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注意要运用“学教并重”教学设计理论进行“信息技术与生物课程整合”的教学设计。现阶段流行的教学设计理论主要有“以教为主”的教学设计和“以学为主”的教学设计两大类，但是由于两种教学理论各有其优势和不足，所以讲两者结合起来形成“学教并重”教学设计理论，这样可以互相取长补短，优势互补。这样教学理论可以充分体现“教师主导作用、学生主体地位”，从而有利于建构以培养学生创新能力为目的的新型教学结构。但是，运用这种理论进行教学设计时，对于以计算机为核心的信息技术不仅可以作为辅助教师“教”的形象化工具，而且还可以作为促进学生自主学习与探究的认知工具和协助交流工具。但是，从长期实践来看，多数教师主要通过利用多媒体课件来辅助教学，较少考虑是否促进学生自主学习和探究学习。因此，并没有很好的充分发挥信息技术与生物课程整合的优势。所以，在“整合”过程中，要基于学生自主学习和探究学习，合理利用各种信息技术，即包括多媒体课件也包括基于网络的研究性学习，如Webquest等，这样才能营造一种更好的信息化教学环境，实现新型教与学方式，转变传统教学结构。